HumanPSD

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HumanPSD数据库介绍
      人类蛋白质调查数据库(The Human Proteome Survey Database,HumanPSD)是关于人类细胞蛋白质及其复合物与这些物质对应的大鼠、小鼠的直系同源物的数据库。
      HumanPSD主要关注人类蛋白与疾病的关联、蛋白是否是潜在的生物标志物。
      HumanPSD内容包括哪些人类蛋白是药物靶标;分子功能;生物作用;定位;蛋白修饰;基因在细胞、组织、器官和癌症中的表达模式;小鼠基因突变的影响;蛋白与基因之间的物理作用和调控作用等。此外,HumanPSD整合了TRANSPATH数据库的信号传导和代谢通路内容。


优势
      1.迅速获得基因、蛋白、miRNA、疾病和药物的详细报告,无需搜索文献,节省时间。
      2.根据已知蛋白功能特征,鉴定潜在治疗靶标,并能从中选择最优靶标。
      3.揭示独立的基因、疾病和药物的生物相关性。
      4.探索经典通路,创建用户自定义蛋白网络,并能够整合已知疾病和相关药物。


主要特征
      1.53,000多个蛋白和4,500个microRNA报告
      2.根据原始文献,参考4,000种疾病(人类)或疾病模型(小鼠),专家总结从计算出110,000个基因与疾病之间的关系
      3.14,000多种药物与蛋白之间的作用关系,其中涉及8,200种药物
      4.人工质控、注释了580,000条基因本体论(GO)信息
      5.461,000多条基因表达信息
      6.936,000多条注释声明
      7.提供381,000篇参考文献
      8.整合的本体论浏览器能够简单选择定义的一组基因或分子
      9.包括TRANSPATH数据库,全面的通路信息能够轻松构建分子与影响的疾病和通路之间的关系


人类蛋白质组调查数据库(humanPSDTM)是以人体蛋白质作为疾病的生物标志物或药物靶点为中心的数据库,本次更新包括:

  整合临床试验的新数据(从146605增加到227170条 CT-疾病-药物相关信息,包含新的数据和改进的绘图)


TRANSPATH数据库在哺乳动物的信号转导和代谢途径中包含以下新的数据特征:

  argetScanHuman 7.1更新增加了4589个miRNA家族条目,实现了24488个miRNA-靶基因的反应从实验证据到语义层次的转变


GeneXplain Platform RELEASE 4.5

 

点击数:6806 录入时间:2017-09-01 16:15:01【打印此页】【返回

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